Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms