Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne7Q0VE82 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms