Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1bQ0MW30 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1bQ0MW30 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms