Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms