Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms