Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms