Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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