Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms