Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms