Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms