Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah1bQ06985 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms