Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms