Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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