Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff2Q03404 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms