Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms