Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms