Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RykQ01887 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RykQ01887 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RykQ01887 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RykQ01887 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RykQ01887 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RykQ01887 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms