Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms