Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms