Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms