Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms