Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp1Q00915 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms