Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms