Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbp4Q00724 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms