Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HmmrQ00547 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms