Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IhhP97812 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IhhP97812 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IhhP97812 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IhhP97812 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IhhP97812 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms