Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlkP97793 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlkP97793 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AlkP97793 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlkP97793 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlkP97793 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlkP97793 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms