Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp1P97350 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms