Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubg1P83887 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms