Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Otx2P80206 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms