Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad1P70340 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms