Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gfi1P70338 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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