Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms