Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PtprvP70289 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprvP70289 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PtprvP70289 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprvP70289 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprvP70289 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PtprvP70289 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprvP70289 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PtprvP70289 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PtprvP70289 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PtprvP70289 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms