Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkn1P70268 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms