Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NficP70255 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NficP70255 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NficP70255 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NficP70255 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms