Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chl1P70232 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms