Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms