Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbdP63072 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbdP63072 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbdP63072 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
UbdP63072 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbdP63072 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbdP63072 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbdP63072 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms