Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms