Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms