Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms