Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sem1P60897 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sem1P60897 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sem1P60897 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sem1P60897 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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