Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms