Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms