Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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