Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox5P52651 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox5P52651 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms