Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms