Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs12P50716 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms