Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms